冬木市第五次圣杯大战结束后五年，远在中国西北多日市的南宫世家，偶然打开异次元缺口，将圣杯引至地下，欲图净化之后独占之。

不料消息走漏，魔术师协会派出百名精英前往中国剿灭，却在危急关头被南宫家家长，南宫正召唤出的英灵Rider扭转乾坤。

却也因此触发圣杯大战，且由于之前的五次战争都以失败告终，圣杯储魔过多，产生了十四骑的名额。

如此，红、黑双方各七骑的第六次圣杯大战正式打响！